BAĞISAKLARIMIZDA 140 BİNDEN FAZLA VİRÜS VE BAKTERİ YAŞIYOR
Bağırsaklardaki virüsler bazı durumlarda, yetersiz beslenme, kalp hastalığı, obezite ve multipl skleroz gibi çok çeşitli hastalık ve koşullarda da rol oynuyorlar.
İnsan bağırsaklarında yuva yapan bakteri, virüs ve diğer mikroorganizmalar topluluğuna bağırsak mikrobiyotası denir.
Bilim insanları, bağırsak bakterilerinin, sağlıklı yaşam ve hastalıklarla yakından ilişikli olduğunu, bu organizmaların metabolizma, bağışıklık sistemi ve sinir sistemi üzerindeki etkilerini uzun zamandır biliyorlar. Bağırsaklardaki virüsler bazı durumlarda, yetersiz beslenme, kalp hastalığı, obezite ve multipl skleroz gibi çok çeşitli hastalık ve koşullarda da rol oynuyorlar.
Ancak bilim insanları, bu bakterileri avlayan virüsler olan bağırsak bakteriyofajları hakkında çok daha az şey biliyorlar. Bu organizmaların da bir kişinin sağlığı üzerindeki etkileri de aynı derecede derin olacağını düşünülüyor. Bakteriyofajlar, bağırsaktaki farklı bakteri türlerinin popülasyon boyutlarını düzenlemenin yanı sıra, genleri, türler arasında aktararak bakterilerde evrimsel değişimi yönlendirir.
Bununla birlikte, insan bağırsağında yaşayan virüslerin çeşitliliği, yaygınlıkları ve insan sağlığı üzerindeki etkileri şimdiye kadar büyük ölçüde bilinmiyordu.
Kolektif genetik diziler
İngiltere’deki bilim insanları yaptıkları yeni bir araştırmada, dünyadaki en kapsamlı insan bağırsak faj genomları koleksiyonu olduğuna inandıkları veritabınını oluşturdular.
Bireylerin içinde yaşayan organizmaların tüm kolektif genetik dizileri olan 28,060 insan bağırsağı “metagenomunda” viral DNA’yı tanımladılar ve sınıflandırdılar. Bu metagenomlar dünyanın farklı yerinden geldi. Ayrıca, izole edilmiş ve kültürlenmiş insan bağırsağı bakterilerinin 2,898 farklı *suşunun genomlarını da analiz ettiler.
Veri tabanı şu anda 140.000’den fazla farklı viral genom içermektedir ve bunların yarısından fazlası daha önce bilim insanları tarafından bilinmemektedir. Ekibin analiz ettiği örneklerin çoğu sağlıklı bireylerdendi. Ekibin tespit ettiği virüsler, RNA kullanan SARS-CoV-2 veya Zika gibi patojenlerin aksine genetik materyalleri olarak çoğunlukla DNA kullanıyor.
Antimikrobiyal tedaviler
Bilim insanları, virüslerin bağırsaktaki tüm mikroorganizmaların kolektif genomu olan “bağırsak mikrobiyomunu” ve dolayısıyla insan sağlığını nasıl etkilediğini araştırmak için yeni veritabanını kullanabilecekler. Örneğin, hastalığa neden olan bağırsak bakterilerini hedef alan, bakteriyofaj temelli tedavilerin geliştirilmesine yol açabilir.
Veritabanı, bağırsak mikrobiyomu ile bireylerin yaşam tarzı, yaşı ve hastalıkları arasındaki ilişkileri belirlemeye yönelik bir ileri adımdır. 2020’de yapılan bir araştırma, bağırsaktaki virüs topluluklarının oldukça değişken olduğunu ve muhtemelen her bireye özgü olduğunu bulmuştu.
Bu yeni araştırma ise, bağırsak fajlarının bileşiminin yaşam tarzına göre de değiştiğini öne sürüyor. Bilim adamları, kentsel alanlarda yaşayan insanlardan elde edilen fajların, Bacteroides adlı bir bakteri cinsini hedef alma eğiliminde olduğunu keşfettiler. Buna karşılık, şehir dışı bölgelerdeki insanlarda ise, Prevotellaceae adlı bir bakteri ailesi keşfedildi.
Çalışma ayrıca bağırsak bakteriyofajlarının çoğunun yalnızca tek bir bakteri türünü enfekte edebildiğini, ancak yaklaşık % 36’sının birçok farklı türü enfekte etme olasılığının bulunduğunu da ortaya koydu.
SUŞ :Probiyotik mikroorganizmaların genetik olarak özelleşmiş alt türleri
